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一般無土栽培營養液用水主要有雨水、井水、自來水和河水等。
(1)雨水：從使用聚氯乙烯薄膜的棚室中接收的雨水會受可塑劑酞酸酯影響，從玻璃溫室接收的雨水易引起硼過剩癥。
(2)井水：多含氯、鈣、鐵、鎂及微量元素鋅、銅、鉬等，需預先分析水中元素含量，以決定營養液配制時的適宜增減量。
(3)自來水和河水：常因殘留氯和混入除草劑引起生育障礙，特別是自來水如未做去氯處理，殘留氯會引起蔬菜根腐病發生。當河水、井水及自來水等營養液用水含鹽量過大時，可用蒸餾法、離子交換法、電滲析法等去除。
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