1、直接漂浮法：用泡沫板等浮體，直接把蔬菜苗固定在漂浮的定植板上進行水培；這種方式雖然簡單，但利用率不高，而且一些雜食性的魚會有吃食根系的問題存在，需對根系進行圍篩網保護，較為繁瑣，而且可栽培的面積小，效率不高，魚的密度也不宜過大。
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2、養殖水體與種植系統分離，兩者之間通過礫石硝化濾床設計連接，養殖排放的廢水先經由硝化濾床或（槽）的過濾，硝化床上通常可以栽培一些生物量較大的瓜果植物，以加快有機濾物的分解硝化。經由硝化床過濾而相對清潔的水再循環入水培蔬菜或霧培蔬菜生產系統作為營養液，用水循環或噴霧的方式供給蔬菜根系吸收，經由蔬菜吸收后又再次返回養殖池，以形成閉路循環。這種模式可用于大規模生產，效率高，系統穩定。
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3、水生蔬菜系統，這種方式就如中國的稻魚共作系統，不同之處在于養殖與種植分離式共生，即于栽培田塊鋪上防水布，返填回淤泥或土壤，然后灌水，構建水生蔬菜種植床，把養殖池的水直接排放農田，再從另一端返還叫集回流至養殖池，這樣廢水在防水布鋪設下無滲漏，而水生蔬菜又能充分濾化廢液，同樣達到良好的生物過濾作用，有點類似自然的的沼澤濕地系統。如茭白與魚共生、水芋慈菇等水生蔬菜的共生，都可以采用該系統設計。
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